MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009332	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009332	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009332	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009332	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009332	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009332	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	139472889
8	NC_009332	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	139472889
9	NC_009332	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472889
10	NC_009332	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	139472889
11	NC_009332	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
12	NC_009332	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
13	NC_009332	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	139472889
14	NC_009332	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472889
15	NC_009332	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
16	NC_009332	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472889
17	NC_009332	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	139472889
18	NC_009332	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472889
19	NC_009332	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	139472889
20	NC_009332	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472889
21	NC_009332	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	139472889
22	NC_009332	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	139472889
23	NC_009332	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
24	NC_009332	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472889
25	NC_009332	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
26	NC_009332	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472889
27	NC_009332	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
28	NC_009332	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139472889
29	NC_009332	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
30	NC_009332	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
31	NC_009332	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
32	NC_009332	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472889
33	NC_009332	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472889
34	NC_009332	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472889
35	NC_009332	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	139472889
36	NC_009332	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009332	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009332	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009332	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009332	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009332	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009332	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009332	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
44	NC_009332	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472890
45	NC_009332	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
46	NC_009332	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
47	NC_009332	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	139472890
48	NC_009332	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
49	NC_009332	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472890
50	NC_009332	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472890
51	NC_009332	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472890
52	NC_009332	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
53	NC_009332	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
54	NC_009332	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472890
55	NC_009332	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
56	NC_009332	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472890
57	NC_009332	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	139472890
58	NC_009332	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472890
59	NC_009332	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472890
60	NC_009332	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
61	NC_009332	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472890
62	NC_009332	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472890
63	NC_009332	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	139472890
64	NC_009332	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
65	NC_009332	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472890
66	NC_009332	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	139472890
67	NC_009332	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
68	NC_009332	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009332	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009332	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009332	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	139472891
72	NC_009332	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	139472891
73	NC_009332	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472891
74	NC_009332	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	139472891
75	NC_009332	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009332	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009332	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009332	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009332	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009332	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009332	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009332	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009332	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009332	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
85	NC_009332	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472892
86	NC_009332	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	139472892
87	NC_009332	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	139472892
88	NC_009332	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	139472892
89	NC_009332	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
90	NC_009332	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	139472892
91	NC_009332	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	139472892
92	NC_009332	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
93	NC_009332	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472892
94	NC_009332	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472892
95	NC_009332	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	139472892
96	NC_009332	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
97	NC_009332	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
98	NC_009332	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
99	NC_009332	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
100	NC_009332	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472892
101	NC_009332	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
102	NC_009332	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472892
103	NC_009332	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472892
104	NC_009332	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
105	NC_009332	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
106	NC_009332	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
107	NC_009332	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472892
108	NC_009332	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472892
109	NC_009332	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009332	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472893
111	NC_009332	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	139472893
112	NC_009332	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472893
113	NC_009332	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472893
114	NC_009332	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472893
115	NC_009332	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472893
116	NC_009332	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472893
117	NC_009332	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472893
118	NC_009332	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	139472893
119	NC_009332	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472893
120	NC_009332	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472893
121	NC_009332	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472893
122	NC_009332	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472893
123	NC_009332	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	139472893
124	NC_009332	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	139472893
125	NC_009332	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
126	NC_009332	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139472894
127	NC_009332	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
128	NC_009332	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
129	NC_009332	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
130	NC_009332	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	139472894
131	NC_009332	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
132	NC_009332	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	139472894
133	NC_009332	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
134	NC_009332	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
135	NC_009332	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
136	NC_009332	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
137	NC_009332	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
138	NC_009332	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
139	NC_009332	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
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401	NC_009332	ATA	2	6	16478	16483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_009332	AGT	2	6	16528	16533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_009332	AT	3	6	16659	16664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_009332	A	7	7	16678	16684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_009332	A	7	7	16762	16768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_009332	A	6	6	16841	16846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_009332	CGC	2	6	17439	17444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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440	NC_009332	GGA	2	6	18215	18220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_009332	TGGT	2	8	18281	18288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_009332	AGCG	2	8	18844	18851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
455	NC_009332	TA	3	6	18865	18870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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